ステージで場面を切り替えているスクリプトとスプライトの両方で「〜秒待つ」があることによりタイミングがずれてきているようでしたので、ステージの方の「〜を送る」を「〜を送って待つ」に代えてみました。ただしそのままだと場面が終わってから背景が変わるようになってしまうので、「背景を〜にする」を「〜を送って待つ」の前に移動しました。これで正しい順番になっているでしょうか?確認して下さい。